Los dos discos de esta edición especial ocupan las dos caras de una sencilla caja doble transparente sin marca y de no muy buena calidad (¿qué ha pasado con las cajas Amaray de Fox?). Pese a que viene cubierta poruna funda de cartón, en el conjunto de la presentación se echa a faltar algún folleto o incluso una sencilla lista de películas. Pero si nos olvidamos de la (mejorable) presentación, los contenidos adicionales alcanzan la máxima puntuación posible en este apartado.
Disco 1:
Menús del primer disco: al principio, se da la posibilidad de escoger entre dos temas diferentes para los menús: La Hermandad o X-Men; es necesario recurrir a ambos para poder ver todos los extras. Sin embargo, es posible cambiar de tema de menú sin rearrancar el disco; para ello, desde el menú extras hay que ir "arriba", hasta que aparezca un símbolo que, una vez seleccionado, cambia la menú del otro tema.

-Comentarios del director Brett Ratner y los guionistas Zak Penn y Simon Hinberg 1h 39' 50'', 16:9, DD 2.0 stereo inglés, subtitulado Excelente comentario, en el que director y los guionistas no se conceden descanso y desgranan un sinfín de anécdotas e información sobre la producción. Así, se puede conocer cómo se hizo el rejuvenecimiento de McKellen y Stewart para el flash-back inicial, qué parte del guión escribió cada uno, cómo para Magneto se usó a modo de inspiración la figura del Che Guevara, los elementos retomados desde la segunda película, el protagonismo de la escuela en el film -con referencias al Hogwarts de Harry Potter-, referencias al terrorismo de Bin Laden y a películas de Kubrick o de Truffaut... Entre los aspectos técnicos, destacan los elogios a la fotografía de Spinotti, información sobre el rodaje en Inglaterra y en Vancouver, la preferencia por el uso de miniaturas como elemento que aporta mayor realismo que el recurso digital - como curiosidad, los hechos que suceden en el puente Golden Gate en el cómic ocurrían en el de Brooklyn en Nueva York-. El director se declara fan de los comics, pero no es un gran conocedor de los de X-men, aunque sí es un admirador de las dos primeras películas de la saga. Elogia a Ian McKellen de quien dice que "le das la guía telefónica y la recita como si fuera Shakespeare". No faltan los chivatazos sobre algunos de los errores de continuidad que aparecen en la película y hablan de la misma como la última parte de una trilogía, aunque reconocen que la escena al final de los créditos abre el camino para una posible cuarta película...
-Audiocomentario con los productores Avi Arad, Lauren Shuler Donner y Ralph Winter 1h 39' 50'', 16:9, DD 2.0 stereo inglés, subtitulado Mucho más técnico que el anterior, con más pausas y menor ritmo. Los productores se centran sobre todo en el proceso creativo: storyboards, animática, decorados, efectos CGI, etc. Hacia el final, rinden homenaje a Bryan Singer, recordando el trabajo en equipo que han hecho durante siete años para los tres films de la saga y afirman que creen que se hará alguna otra película sobre estos personajes.
-Menú X-Men: Escenas eliminadas o alternativas 9' 56'' (Opción play todas), 16:9, DD 5.1 Inglés, DD 5.1 Castellano, DD 2.0 Comentario (Inglés), subtitulado Estas escenas no incluidas en el montaje final están completamente terminadas y dobladas. Cuentan con comentarios opcionales del director Brett Ratner y los guionistas Zak Penn y Simon Hinberg. Todas ellas pueden verse en inglés, dobladas o comentadas. Sus títulos son:
- Pruebas de voz de Xavier (0' 31'')
- Versión alternativa: La Bestia conoce a Logan (0' 30'')
- Escena de lucha extendida en casa de Jean Grey (1' 37'')
- Versión alternativa: Bobby y Kitty patinan (1' 07'')
- Fabricación de armas de plástico (0' 31'')
- Hank les advierte del plan de Magneto (0' 38'')
- Versión original: Los X-Men suben al jet (1' 15'')
- Jean siente a una niña asustada (0' 43'')
- Tormenta crea una ola (0' 36'')
- Bestia rompe un cuello (0' 18'')
- Bobby conoce a Pyros (0' 21'')
- Final alternativo: Empieza un nuevo curso (0' 40'')
- Final alternativo: Logan vuelve a Alberta, Canadá (1' 15'')
-Menú Hermandad: Escenas eliminadas o alternativas 9' 25'' (Opción play todas), 16:9, DD 5.1 Inglés, DD 5.1 Castellano, DD 2.0 Comentario (Inglés), subtitulado Nuevamente disponen de comentarios opcionales del director Brett Ratner y los guionistas Zak Penn y Simon Hinberg. Todas ellas pueden verse en inglés, dobladas o comentadas.
- Jimmy en el Laboratorio (0' 34'')
- Pyros le cuenta a Magneto lo de la cura - versión sin barba (0' 45'')
- Pyros le cuenta a Magneto lo de la cura - versión con barba (0' 45'')
- Versión alternativa: El guardia le grita al presidente (0' 24'')
- Voces de la batalla psíquica (1' 49'')
- Versión original: Jean despliega sus fuerzas en el campamento (1' 36'')
- Fabricación de armas de plástico (0' 31'')
- Magneto le pide ayuda a Jean en la batalla (0' 37'')
- Versión alternativa: Que viene Juggy (0' 16'')
- Magneto tortura a Logan (0' 42'')
- La destrucción de Fénix, versión extendida (0' 48'')
- Final alternativo: El regreso de Pícara (0' 44'')
-Contenido oculto (huevo de pascua) 1' 07'', 16:9, DD 2.0 Inglés, DD 2.0 Castellano, subtitulado Desde el menú de escenas - capítulos 10 a 12 - activar un símbolo con una X. Veremos el clip titulado La Bestia recita a Shakespeare.
-Contenido oculto: El Jet aterriza en Washington DC 0' 34'', 16:9, DD 2.0 Inglés, DD 2.0 Castellano, subtitulado Es un vídeo promocional del principio de la producción, cuando se suponía que la acción ocurriría en la capital. Se accede al mismo desde la última página del menú de escenas eliminadas, yendo hacia arriba.
-Información exclusiva: 1' 15'', 16:9, DD 2.0 Inglés, DD 2.0 Castellano, subtitulado Fragmento de storyboard animado de Los Simpson la Película, actualmente en fase de producción.
-Antes del menú principal: anuncios de La Sombra de la Sospecha, Los Cuatro Fantásticos, Daredevil y X-Men 2 8' 52'', 4:3, DD 2.0 Castellano Pueden saltarse con la tecla de menú o la de avance de capítulo.
Disco 2:
-Menú Producción
- El diario de producción de Brett Ratner
41' 20'', 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Excelente documental ordenado cronológicamente y repleto de filmaciones tras las cámaras tomadas durante la producción, que demuestra el interés del director por compartir su trabajo con los espectadores. Comienza con la pre-producción, la búsqueda de localizaciones en escenarios naturales, en calles de una urbanización, los preparativos de los efectos mecánicos con coches, las reuniones de trabajo, la preparación de las animáticas por ordenador, etc. Posteriormente, asistimos al primer día de rodaje en la mansión de la escuela de Xavier, para continuar con la filmación del funeral, la secuencia nocturna de patinaje, el retorno a Vancouver para rodar las escenas de acción y combate en la Sala del Peligro, las escenas en el lago y las de la Hermandad en medio del bosque, el vuelo de Ángel, el ataque al camión prisión, el enfrentamiento en la casa de Jean, el ataque al laboratorio en Alcatraz, el puente Golden Gate... y así hasta llegar al último día del rodaje, con el enfrentamiento entre Lobezno y Fénix. Además del director y de los actores, hablan Ed Verreaux, diseñador de producción, Ralph Winter productor ejecutivo, Jamie Freitag co-productor, Gary Hawes (tercer asistente de dirección), David Gorder y Lee Cleary (productores asociados), el coordinador de efectos especiales Mike Vezina y varios técnicos más. Sorprende favorablemente el limitado uso de pantalla verde que hacen Ratner y su equipo, utilizando en cambio muchos efectos especiales clásicos: explosiones pirotécnicas, vuelos con cuerda... La última parte del reportaje está centrada en la presentación de la película en el festival de Cannes, seis meses después de de terminar el rodaje, con la presencia de director, actores y equipo.
- X-Men: Evolución de una trilogía
43' 08'', 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Es otro interesante documental, con entrevistas a Brett Ratner, los productores (Lauren Shuler Donner, Tom de Santo y Ralph Winter), Avi Arad (productor ejecutivo) y actores como Patrick Stewart, Ian McKellen, Hugh Jackman o Halle Berry, etc. En él, se habla de la historia y de los personajes de la franquicia X-men, a través de sus tres películas -las dos de Bryan Singer y la de Ratner-. El último tercio del documental está dedicado al último film de la saga, con la presentación de varios de los personajes mutantes que debutan y que adquieren una importancia creciente de cara a posibles continuaciones. Escenas de la película y entrevistas se alternan con viñetas de los cómics y con algunos fragmentos de tomas durante el rodaje.
- X-3: La emoción continúa
20' 25'', 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Documental claramente más promocional que los dos anteriores, centrado en esta tercera película, en el que actores y técnicos no paran de repetir lo bien que se lo pasaron haciéndola. Participan el director, Kevin Feige y Stan Lee (productores ejecutivos), los productores, guionistas (Simon Kinberg y Zak Penn), Chris Claremont (autor de comics), David Gorder (productor asociado) y Avi Arad (productor ejecutivo). Aunque reitera muchos elementos de los elementos de los documentales anteriores, consigue aportar también una cierta dosis de información adicional que los fans de la saga y de los comics sin duda agradecerán.
-Menú Documentales:
- X-Men de Cerca
22' 25'', 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Cerca de 83 vídeos cortos con entrevistas o fragmentos de las películas y un sinfín de páginas de texto, galerías de diseños y de fotografías, etc. componen esta guía interactiva de todos los personajes X-men. Lamentablemente, los textos están sólo en inglés pese a que los clips en vídeo sí están subtitulados.

- Anatomía de una escena: El puente Golden Gate
12' 04'', 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Kevin Feige (productor ejecutivo), los productores Ralph Winter y Lauren Shuler Donner y John Bruno (supervisor efectos visuales), junto con el director, presentan los entresijos de esta compleja secuencia, la cumbre de la demostración del poder de Magneto. Se ven diseños iniciales en blanco y negro, dibujos en color, construcción de una maqueta, animática digital, filmación en escenario con pantalla verde al fondo, fotografía aérea de la bahía de San Francisco, maquetas de gran tamaño (puente a escala 1:12) , etc.
-Menú Galería de animáticas 24' 41'' (play a todo), 4:3, DD 2.0 Inglés, subtitulado Un amplio muestrario de las animaciones informáticas usadas a modo de storyboard para planificar el rodaje:
- Jean Grey adolescente (0' 55'')
- La habitación del peligro (2' 49'')
- La interrogación de Mística (0' 59'')
- Jean emerge del lago (2' 17'')
- La mirada de Logan y Tormenta a Scott (1' 34'')
- Jimmy conoce a su amiga mutante (0' 28'')
- Ángel se escapa (1' 34'')
- La huida de Mística (1' 45'')
- Jean mata a Xavier (2' 13'')
- Ángel aterriza en el colegio (0' 19'')
- Magneto habla con Jean en el bosque (0' 23'')
- Logan lucha con Spike (1' 32'')
- El señuelo del hombre múltiple (1' 03'')
- Magneto mueve el Golden Gate (2' 27'')
- Ángel se une a la lucha (0' 34'')
- Ángel salva a su padre (0' 19'')
- Ash quema a los soldados (0' 10'')
- Los mutantes de Omega entran en el Laboratorio (0' 14'')
- Juggernaut persigue a Kitty (0' 41'')
- El final de Fénix (2' 39'')

-Menú Viñetas 25' 58'' (play a todo), 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado Una serie de documentales cortos, dedicados a algunos aspectos muy concretos de la producción y de la historia.
- Profecías
4' 21'' Un repaso a las profecías y otras historias ocultas procedentes de los comics que se han usado en las tres películas de la saga.
- La política de X-men
4' 00'' Un repaso, con director, productores y actores, al mensaje político de la película: la discriminación, los peligros del poder...
- Ropa y trajes
4' 01'' Judianna Makovsky presenta los cambios introducidos en el vestuario de esta tercera película .
- Confesiones en la silla de maquillaje
2' 57'' Los actores que hacen de mutantes hablan de las transformaciones que han de sufrir para el rodaje, mientras se ve cómo son maquillados y se les aplican prótesis.
- Armas para elegir
3' 00'' Jimmy Chow, de atrezzo, muestra las armas que usan en X-Men III, con énfasis en las armas de plástico especiales para luchar contra Magneto.
- Efectos en el decorado
2' 25'' Un rápido repaso con los productores a algunos de los mejores efectos especiales de la película, incluyendo complejos decorados y un hielo"de mentira" hecho con teflón.
- Aprendiendo a volar
5' 18'' Otra de las dificultades para los actores es simular vuelos y grandes saltos por el aire. Un rápido vistazo al rodaje de algunas de estas escenas, como la de Tormenta en la Sala del Peligro.
-Menú Blogs 14' 15'' (play a todo), 16:9, DD 2.0 Inglés, subtitulado. Unos clips cortos procedentes de la web, originalmente destinados a promocionar la película
- Avance de producción
0' 57'' Se muestran algunas secuencias filmadas durante el rodaje.
- En directo desde la habitación del peligro
3' 14'' El director Brett Ratner nos muestra el escenario que representa la ciudad en guerra, en la Sala del Peligro.
- Cameos Marvel
3' 01'' Stan Lee y Simon Kinberg (escritores) y Chris Claremont (autor del cómic) nos acompañan un día del rodaje, para conocer a los personajes cinematográficos que dan vida a sus criaturas del cómic.
- Editando la magia
7' 04'' El montador Mark Helfrich, colaborador habitual de Ratner, habla del esfuerzo realizado en la sala de montaje para conservar la coherencia de argumento y personajes. Más interesante resulta la explicación de cómo las impresiones de los montadores pueden obligar a rodar algunas escenas nuevas, cambiando detalles de personajes y de la historia.
-Menú Galerías 16:9, en total son algo más de 300 imágenes Un sinfín de galerías, con avance manual entre cada fotografía, clasificadas de la forma siguiente:
- Imágenes de los personajes: Ángel, Bestia, Callisto, Coloso, Cíclope, Iceman, Juggernaut, Kitty, Magneto, Mística, Jean Grey / Fénix, Profesor Xavier, Pyro, Pícara, Tormenta, Lobezno.
- Storyboards y maquetas: Ángel se escapa del laboratorio, La Habitación del Peligro, El puente Golden Gate, Jean vs. Xavier, Fénix vs. Lobezno. Para cada una hay storyboards, arte conceptual y fotos de las maquetas.
-Menú Trailers
- Tráiler A
1' 32'', 4:3, DD 2.0 Inglés
- Tráiler B
2' 20'', 4:3, DD 2.0 Inglés
- Tráiler extendido
6' 54'', 4:3, DD 2.0 Inglés |